病假期间公司未发工资,两年后可以起诉吗

当然允许。在员工申请病假的过程中，若公司拒绝发放薪酬，这无疑是违反法律规定的行为。根据相关法规，员工在病假期内，只要处于法定医疗期限之内，雇主就有责任按照地方最低工资标准的80%来制定薪酬发放方案，并且该方案应由雇主自行决定。所谓医疗期，即指企业员工由于患病或者由于工伤导致无法继续进行工作，须接受治疗和休息，同时也不能解除其与雇主之间的劳动合同的时间范围。
《工资支付暂行规定》第十二条非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理。