在a公司工作，但签订的劳动合同的工资由B公司支付。我不知道他们之间的关系是什么。

法律分析：当公司和劳动者之间产生一定的争议的情况下公司可以起诉员工，法院处理劳动争议案件和处理一般民事纠纷一样，其主要程序有一审程序、二审程序、审判监督程序等。劳动者与用人单位之间发生的下列纠纷，当事人不服劳动争议仲裁委员会作出的裁决，依法向人民法院起诉的，人民法院应当受理：(1)劳动者与用人单位在履行劳动合同过程中发生的纠纷;(2)劳动者与用人单位之间没有订立书面劳动合同，但已形成劳动关系后发生的纠纷;(3)劳动者退休后，与尚未参加社会保险统筹的原用人单位因追索养老金、医疗费、工伤保险待遇和其他社会保险费而发生的纠纷。法律依据：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第五条发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。