哪个部门报销农村合作医疗二次报销？

二次报销可以到医院的大病结算窗口，或者可以去当地医保机构。大病保险覆盖城镇居民基本医疗保险、新型农村合作医疗参保人群，申请成功后，有关二次报销的比例各地区也有所差异，一般来说需遵循分段计算和累加支付的方式。法律依据：《国务院办公厅关于全面实施城乡居民大病保险的意见》三、提高大病保险保障水平（一）全面覆盖城乡居民。大病保险的保障对象为城乡居民基本医保参保人，保障范围与城乡居民基本医保相衔接。参保人患大病发生高额医疗费用，由大病保险对经城乡居民基本医保按规定支付后个人负担的合规医疗费用给予保障。高额医疗费用，可以个人年度累计负担的合规医疗费用超过当地统计部门公布的上一年度城镇居民、农村居民年人均可支配收入作为主要测算依据。根据城乡居民收入变化情况，建立动态调整机制，研究细化大病的科学界定标准，具体由地方政府根据实际情况确定。合规医疗费用的具体范围由各省（区、市）和新疆生产建设兵团结合实际分别确定。